為了使胸腔疾病得到快速診斷與治療，本科同時具備完整的肺功能檢查，支氣管鏡檢查，胸腔超音波檢查，呼吸睡眠生理檢查所需的人員與設備，以及胸腔專科病房，呼吸重症加護病房及肺結核隔離病房等單位，對於醫療與教學提供完整的設備與環境。另有肺癌、重症醫療、睡眠中心等特色醫療。
肺癌團隊
肺癌整合診斷治療的推動包括各類支氣管鏡與超音波檢查、完整肺癌分期評估、團隊討論、完整肺癌治療準則等。這幾年本院各科醫師共同努力下，有相當好的口碑，由癌症登記資料反應出高雄院區所照顧病人數及增加趨勢。
睡眠中心
整合胸腔內科、耳鼻喉科、精神科、兒童心智科、神經內科、牙科、中醫以及顱顏外科等等各相關科別的專業知識，在共同會診後為病患量身訂製最佳治療方案，再由醫師、心理師以及睡眠技術員等專業人員，提供病患最完善的治療與人性化的照護。
重症醫療團隊
醫學大樓13F, B區為內科第一,第二, 第五加護病房所在, 總床數共計34床,收治內科重症病患, 病患來源除了原內科病房住院病患,亦接手由其他科別有需要支援之重症患者, 對於由急診及其他醫院轉入之重症病患,本中心提供完整之照護.
三個加護病房分別床數:12床, 12床, 10床;平均住院天數：10天, 10天, 9.9天;平均佔床率：96.5%,97.2 %, 96.9%,護理人員數: 29人,30人, 25人, 30間病房有完整獨立隔間, 其中3間為完整負壓隔離病房。 人員編制包括3名病房主任, 主治醫師群 (皆有重症醫學聯委會專科證書: 共約20人按既定規劃入內照顧病患), 團隊成員亦包含專責之呼吸治療師,藥師,營養師,及護理人員等等, 為急重症病患提供最優良之整合照護。
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