長庚紀念醫院在 王董事長回饋鄉里，照顧地方民眾健康福祉之願望及嘉義縣縣政府照顧縣民，提升民眾的健康醫療與生活水準之美意下，於朴子市建設醫療專用區。本著教學、研究與服務全方位先進醫療的理念，在九十一年一月十六日開幕之初即以構築最先進的全電腦化醫學、教育、療養中心為藍圖，人員亦皆為各院區最具活力的一時之選。本院規模並不龐大，但是堪稱人才濟濟，服務品質以世界級標準為標的，發展潛力將是不可限量。
本科創科主任黃東榮醫師為英國倫敦大學帝國學院醫學博士，鑽研呼吸道疾病；於長庚紀念醫院服務十數年，除了呼吸道疾病之外，對於各種胸腔病及重症加護醫療皆具豐富的經驗與心得。楊政達醫師為長庚紀念醫院副教授級主治醫師，專長於肺癌診治及重症照護，曾於美國加州大學舊金山分校以及加拿大英屬哥倫比亞大學進修肺癌基因療法，於94年接任科主任至98年11月。林裕清醫師自98年12月接任主任至103年1月。103年2月改制為胸腔內科系，下轄三個次專科（胸腔腫瘤科，肺感染及重症科，呼吸道及睡眠醫學科）。謝孟哲主任於103年2月接任系主任至今。林裕清主任於109年7月接任系主任至今。檢查室蘇妙真、黃慧珍、吳子琳技術員，睡眠檢查中心張薷方、吳佳綺、陳加恩技術員亦皆為工作多年之優秀醫療人員。
呼吸胸腔科在未來幾年，在臨床醫療方面，除了持續加強及維持高標準的人本醫療品質之外，將以開放的心胸，融入當地社群，結合主管機關、醫師公會、醫學會、當地醫療院所與病友組織共同合作，建立完整的醫療轉送與諮詢網絡；在醫學研究方面，主治醫師群研究經驗及能力卓著，開幕迄今已執行多項研究計畫。更將尋求與醫學會、其他專科及醫療機構進行跨科、跨院區或全國性合作計畫。並與國際先進研究機構保持密切互動，以研究質量進軍國際舞台；在醫學教育方面，除了配合長粳技術學院以及長庚大學研究所分班的漸次設立為未來醫護人才的培育貢獻心力之外；亦於九十三年經台灣胸腔暨重症加護醫學會審核評定為合格之呼吸胸腔科專科醫師訓練醫院，得以培養高級次專科人才。本科並積極鼓勵新進醫師及護理、檢驗人員進修，以提昇專業知識與研究能力，積極鼓舞全科的學術風氣。
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